阴阳合同走法律程序法院将依据相关法律法规和司法解释的规定进行审理，会重点审查双方真实意思表示的合同内容并据此判断合同的效力。阴阳合同中涉及税务问题的法院将通知税务机关进行处理。
阴阳合同的核心是存在两份或更多份内容不一致的合同文本，根据《民法典》第一百四十六条的规定：“行为人与相对人以虚假的意思表示实施的民事法律行为无效。以虚假的意思表示隐藏的民事法律行为的效力依照有关法律规定处理。”
阴阳合同中的阳合同是对外公开的、以虚假意思表示签的合同是无效的，阴合同是隐藏的真实意思表示的合同需要根据相关法律规定来判断效力。
1、法院处理民事法律关系
法院原则上只处理民事法律关系即判断合同的有效性，对于阴阳合同中的两份或多份合同会重点审查哪一份是双方真实意思表示的合同并以此为基础判断合同的效力。
2、税务问题由税务处理
法院在审理过程中会发现阴阳合同中的税务违法行为但并不会直接处理，根据《税收征收管理法》等相关法律法规规定：税务问题由税务机关负责处理。
1、确认真实意思表示的合同有效
如果法院认定双方真实意思表示的合同是有效的，那么这份合同将作为双方权利义务的依据。而对外公开的以虚假意思表示签订的合同部分会被认定为无效。
2、追缴税款给予行政处罚
对于阴阳合同中涉及的税务违法行为会通过司法建议书等方式通知税务机关进行处理，税务机关将根据具体情况追缴税款、滞纳金并处以罚款。构成犯罪的还会依法追究刑事责任。
3、处理民事纠纷
在确认合同有效性的基础上会进一步处理由此产生的民事纠纷，在房屋买卖合同中如果双方因为阴阳合同产生纠纷，法院会依据有效的合同内容来判决房屋归属、价款支付等事项。
